Na página Indicar diretório base do assistente de makefile, especifique o diretório onde você deseja que o IDE execute o comando make. O assistente não exibe esta página se você tiver selecionado um dos modelos para um simples makefile.
Na maioria dos casos, o diretório base é a localização do makefile e da árvore do código-fonte. Você pode colocar o makefile no diretório base e os arquivos de código-fonte em outro diretório. Entretanto, se fizer isso, você só poderá executar o comando make no makefile do IDE se definir a propriedade Construir diretório do makefile para o diretório base